先天性髌骨脱位病因多为膝关节先天性发育不良所致，如先天性膝关节的关节囊疏松，高位有髌骨，还有膝内翻或膝外翻，是俗称x型腿、o型腿。
由于这些因素使髌股韧带不能完全闭合而发生了一系列症状。这类患者活动激烈，尤其跑跳活动频繁，髌骨突然受到某种压力后，造成髌骨在正常解剖位置脱出，导致髌骨脱位。另外还可能由于一些特殊因素造成髌骨脱垂，从而出现严重的症状。因此，先天性髌骨脱位多由先天发育异常所致，尤以关节囊疏松为甚，高位之髌骨及膝关节先天性发育异常，x型腿或o型腿所造成。