纤维肌痛症相关性睡眠障碍与运动、损伤、肌肉疲劳、病毒感染、免疫机能紊乱等因素有关。
大部分病人会出现苦恼、焦虑、抑郁、紧张等症状。目前，人们普遍相信，五羟色胺是一种上升期的投射系统的抑制性传递素，与觉醒和入睡有关，在睡梦中，大脑中五羟色胺浓度升高，而在清醒状态下则会降低，而在睡梦中，血液和大脑中的五羟色胺浓度会降低，从而导致对痛觉的敏感度升高，从而导致失眠、忧郁症和痛楚。