肩膀骨头酸疼的原因主要有以下几种：第一，可能是长期保持同姿势或长期剧烈运动造成的疲劳性损伤。第二可能是缺钙，需要去医院做微量元素监测，或者口服葡萄糖酸钙口服液或者高钙片补充钙质。第三可能是骨质增生，关节退化，需要卧床休息，不要过度劳累。需要患者及时就医明确具体病因，同时对症进行治疗，防止病症加重，影响身体健康。