通常来说，巨趾畸形是神经支配异常、血供异常、体液系统异常等原因引起的。
目前尚不明确的致病原因，未见显著的基因因子，且对基因的分析也未见阳性结果。部分学者认为这是由于在胚胎发育过程中，部分抑制因素对其产生的影响导致的，目前已有研究表明，神经支配异常、血供异常、体液系统异常可能是诱发因素。但如果出现这种情况，建议患者积极去医院检查，然后在医生的指导下进行对症治疗。