真菌性关节炎要做如下检查：
1、实验室检查：
(1)大部分病人的血液沉淀加速（通常为50毫米/小时或更高），并且白细胞可以轻微地升高。
(2)对膝关节进行穿刺，取出粘液膜进行显微镜下观察。滑膜液体化验往往是发炎的征象；骨质疏松症主要表现为：血清中的糖、蛋白、白细胞、白细胞，尤其是中性白细胞增多、粘蛋白凝固不良。几乎没有真菌存在于滑膜液体中。
2、X线片：骨腔狭窄或有骨块，近端骨质破坏疏松，矿物质含量降低，骨膜鼓胀，软骨周围有骨瘤或骨瘤，软组织肿大。
3、关节镜：关节镜是一种用于关节腔内的内窥镜，主要用于观察滑膜、软骨、半月板、韧带等，尤其是关节镜下滑膜，对不同类型的关节炎有较好的诊断价值。
4、组织培养：对病灶组织液、滑膜进行培养，可以确定是否有真菌性，从而确定病原菌种类，并对其进行相应的处理。
5、分离病原体的检测：如果不能明确病原体的种类，可以对病原体进行分离，从而进行确诊，从而进行后续的处理。