一般情况下，畸形性骨骼炎的发病机制尚不清楚，主要有病毒学说、遗传学说、内分泌紊乱学说、自主神经系统紊乱学说等。
畸形性骨骼炎是一种病毒的长期传染；目前已有不少研究发现，患者体内有病毒mRNA。畸形性骨骼炎与基因有关。近几年，由于对该种疾病的深入了解，已有许多学者注意到其家庭聚类的特征；可能是由于内分泌失调引起的畸形性骨骼炎。自主神经功能紊乱会导致血液循环紊乱，心脑排血量增多，营养骨骼中的血管供血增多，从而导致骨骼的局部充血，从而促进成骨细胞的代偿和新生骨骼的数量增多，从而导致畸形性骨骼炎。
如果患有畸形性骨骼炎，建议患者及时去医院就诊，查明病因后对症治疗。