一般情况下，肩肌腱损伤可以通过日常护理、手术等方式进行治疗，具体内容如下：
肩部肌肉的疼痛可以通过保守治疗，比如肩关节的放松，比如使用依托考昔等一些抗炎镇痛的药物。患者应该注意调整自己的生活习惯，尽量减少做抬肩运动，并通过训练没有受伤的肩袖肌腱来补偿受损的肩袖肌腱。如果损伤情况比较严重，患者可以进行手术治疗，如果不能有效地进行手术治疗，一般都是通过关节镜进行手术，修复受损的肩袖肌肉，有较好的治疗效果。