跑步后关节疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
第一、跑步运动会对关节的冲击，导致关节软骨损伤，从而出现关节疼痛的情况，一般是比较轻微的，不会影响到日常的锻炼，一般在休息几天后就会消失。
第二，如果患者有半月板损伤史，长期跑步会导致半月板的损伤加剧，导致关节疼痛。
第三，如果患者有关节炎史，长期跑步会导致关节内部的压力升高，从而出现关节疼痛。