骨质疏松药物治疗其主要功能有通过抑制破骨细胞的活性，促进破骨细胞凋亡，从而抑制骨吸收，减少骨转化，保持骨平衡。
常用的药物有副甲状腺素、前列腺素、他汀类降脂药、氟化物等都是有助于骨形成的药物。其作用机理为增加成骨细胞数目、促进成骨细胞的分化与钙化、增强成骨细胞活力、抑制成骨细胞凋亡等。另外，雌激素能有效地抑制骨吸收，减少骨转化，提高骨密度，尤其是在更年期。