临床对肩胛骨骨折后患者，如积极配合治疗和做康复训练，通常不留后遗症。因为肩关节本身具有一定的运动能力，所以可以作为一个独立的系统来发挥其重要的作用。但对肩胛骨断裂后，如不积极处理，会造成一系列后遗症。所以一定要对这一疾病加以重视。临床常见后遗症仍有如下两种：
一、肩胛骨骨折错位显著，但未主动切开复位内固定，恢复正常的解剖结构，会使骨折无法愈合，或畸形愈合，因而影响了患者的正常功能。
二、虽经主动配合治疗。骨折愈合亦较良好，但因长期未动，肩关节有僵硬，等以后会运动了，患者因怕痛而缺乏运动，会使肩关节的活动度很不好，因而影响了患者的正常功能，见肩胛骨骨折常见后遗症。