早晨起床腰部僵硬疼痛可能是以下原因：
1.腰椎病变，主要表现为坐姿不正、腰椎损伤、腰椎压缩骨折、腰椎间盘突出等，主要是由于局部神经受到挤压而导致的腰椎僵直、疼痛，CT可以确诊为腰椎间盘椎管。
2.风湿性免疫病，主要见于SLE、强直性脊柱炎等，主要表现为骶尾部，腰间关节融合，伴有持续性的僵硬性疼痛。
3.急性腰肌劳损，主要表现为剧烈的活动，工作后会有腰酸背疼、早上起床时会感觉到腰疼。