3岁宝宝发烧39度首先要口服退烧的药物，其次还需要结合物理降温的方法，延长退热药的作用时间，减少退热药的副作用，比如可以采用退烧贴贴在宝宝的额头、颈部、后背、手心和脚心，退烧时间比较长，退烧的作用并不是很强，但是具有保护孩子脑部功能的作用。