小儿阴茎短小需要考虑雄激素水平减低以及肥胖引起的假性隐形阴茎。阴茎的发育需要雄激素刺激，如果雄激素水平降低，可以导致阴茎发育迟缓短小等，需要做性激素测定。过度肥胖可以引起阴茎根部脂肪垫增厚，表现为阴茎短小，临床上称为假性隐匿性阴茎，需要控制体重。