组成不同，理中丸由人参、干姜、白术、甘草组成，附子理中丸是在理中丸的基础上加入了一味温阳的附子。作用机理不同，理中丸是治疗脾胃气虚证的中成药，其机理是脾胃的功能下降，属于动力不足；附子理中丸是治疗脾胃虚寒证的中成药，除了动力不足外，其产生这种动力的源泉亦受损，即脾阳亏虚，程度比理中丸更重。