内眼角的麦粒肿可以通过药物来进行治疗。内麦粒肿是因为细菌感染了睑板腺的组织，引起了局部组织的急性炎症。比如红、肿、热、痛等。点妥布霉素眼药水、氧氟沙星眼药水、左氧氟沙星眼药水等都需要在早期给予足够的剂量。
如果有明显的炎症，可以使用眼药膏。可以选择妥布霉素、氧氟沙星等眼药膏，可以在结膜囊里涂上。大多数的内麦粒肿可以用抗生素进行消炎处理。但如果毒性比较大，身体条件和免疫力都比较差，甚至会出现脓肿，需要手术。