眼睑结膜结石可以在表面麻醉下用针将结石挑出。术后用抗生素滴眼液预防感染。本病的发生与睑板腺功能障碍有关，因此积极治疗睑板腺功能障碍也能对睑结膜结石的发生，起到预防的作用。可以通过做眼部热敷，促进眼部血液循环，软化腺管内的分泌物，做睑板腺按摩，促进分泌物排出。可以酌情使用抗生素抗感染对症治疗。