治疗血清阴性脊柱关节病主要有药物治疗和非药物治疗两种。一定要在医生的指导下进行治疗。
非药物治疗包括日常的保养和保健，主要包括养成良好的生活作息习惯，戒除不良嗜好，同时还要注意不间断的体育锻炼，增加脊柱关节周围韧带、肌肉的力量，预防疾病的进一步发展和并发症的发生。
药物治疗需遵医嘱选择非甾体抗炎，免疫调节制剂，生物制剂等药物治疗。非甾体抗炎镇痛药物主要有消炎镇痛、缓解炎症、延缓疾病进展的作用。糖皮质激素、柳氮磺胺嘧啶、甲氨蝶呤等免疫调节制剂均可用于治疗关节炎症或相应的免疫反应，生物制剂主要针对特异的免疫介质或炎症介质进行干预，从而达到治疗的目的。不能自行用药，否则可能会出现不良的副作用。