韦格纳肉芽肿病属于自身免疫疾病，属于肉芽肿性血管炎，属于坏死性肉芽肿性血管炎。病变涉及小动脉，静脉，毛细血管，偶尔还会累及主动脉。病理学特征是血管壁炎症，主要侵犯上、下呼吸道和肾脏，一般先发生于鼻粘膜和肺组织的局部肉芽肿性炎症，继而发展为血管扩张性、坏死性和肉芽肿性炎症。
初期症状主要有发热、疲倦、抑郁、体重减轻、关节疼痛、尿液颜色改变、无力等。大多数患者都会出现上呼吸道病变，常表现为持续流鼻涕并持续加重。还会出现胸闷、气短、咳嗽、咯血、胸膜炎等下呼吸道症状最常见。