组织学检查对多肌炎、皮肌炎的诊断有很好的参考价值。
在多肌炎的活化组织中，一般使用紊-伊红染色可以发现不同程度的肌纤维，如肌纤维变性、坏死、新生、炎症等，这些都是没有特征性的，主要是由于不同的原因所致的肌病，无法将多肌炎与其它的病症区分开来。通过免疫组化法，发现肌上有一种组织兼容的复合物，其侵袭的炎性细胞以CD8t为主，以肌纤维和肌纤维为多层，是多肌炎的典型特征，也是临床上确诊多肌炎的一个重要指标。