更昔洛韦与阿昔洛韦之间存在着药物组成、应用范围及毒副作用等方面的差异。
1.药物组成：更昔洛韦是更昔洛韦中的重要组分；阿昔洛韦是阿昔洛韦的重要组分。
2.应用范围：更昔洛韦适合因机体免疫功能受损而导致巨细胞病毒感染的病人；阿昔洛韦可用于初次及再次发病时，对再次发病时使用，也可用于防治，对具有良好免疫机能的带状疱疹及免疫机能低下患者，可用于轻病症时使用。
3.毒副作用:更昔洛韦最常见的毒副作用包括胃肠、肝脏、腹部等功能异常；阿昔洛韦在临床上最常见的副反应为恶心、呕吐、腹泻等。
上述的药物一定要在医嘱下服用，避免出现延误。