角膜真菌感染的治疗方案需要根据真菌入侵角膜的情况来制定，遵循医嘱进行规范治疗。治疗主要包括抗真菌药物局部和全身应用，例如5%那他霉素滴眼液、0.5%氟康唑滴眼液、酮康唑滴眼液等。在治疗过程中，应根据病情轻重联合膜瓣遮盖术、角膜移植等手术治疗。
同时，在治疗过程中要注意遵医嘱规范治疗，避免病情恶化。