阿托品眼药水的主要副作用包括眼睛局部的副作用(如视物模糊、夜间视力下降、眼睛疼痛或刺痛等)和全身性副作用(如快速或不规则的心跳、口干或眼干、嗜睡等)。在使用阿托品滴眼液期间，这些副作用可能会消失，但也可能会出现其他严重不适反应，如谵妄或烦躁、心动过速、皮肤和面部潮红、幻觉等。
如果在使用阿托品滴眼液后，出现严重的不适反应，请及时前往医院就诊。