鼻中隔脓肿是全麻的，一般情况下，患者是不会感觉到疼痛的.
在术中，医生会在鼻腔底部开一个横向的切口，将脓肿内的脓液清理干净，然后再去鼻中隔的软骨，看是否有坏死，如果有坏死，就去除掉坏死的软骨，尽可能的保存完整的。手术后要用抗生素溶液清洗，留置引流条等，术后还要进行局部填充，当然，术后患者会感觉到疼痛，但患者可以承受。
鼻中隔脓肿在没有做手术的时候，在没有做脓肿的情况下，局部会比较疼痛，但是当脓肿被取出来的时候，疼痛会慢慢的消失。