马凡综合征以心血管病变为主，一般是采用对症治疗。
在发病初期积极处理心脏瓣膜病变能减少或防止心源性休克和心力衰竭发生。尤其伴有主动脉瘤者，要早发现、早处理。目前尚无特殊疗法和特效药物。因此，该病以预防和治疗心血管并发症为原则，对症的支持治疗，如有需要，则进行手术处理。在药物治疗上采用男性激素和维生素，主动脉病变可给普萘洛尔治疗。