肺栓塞多由静脉血栓脱落所致，肺栓塞发生后，必须抓紧治疗。
首先要判断肺双塞轻重，是否为大块或小面积肺栓塞。如果已经发生了大面积肺梗死或者出血的话，就可以考虑使用溶栓进行抢救。此情况应决定是否进行溶栓治疗，这是非常关键的。如果已经完全没有血液流动了，那么也不能再进行其他药物治疗，因为在这期间可能会引起出血或者凝血障碍等并发症。也有要求抗凝的，选用华法林特别是华法林需长时间使用，通常需抗凝6个月至一年。另外对于一些比较大的肺动脉高压患者来说，在进行了药物或者外科手术后都可能会出现这样那样的问题，比如肺功能下降等。
也可采取手术治疗，例如，确认血栓的存在，特别是深静脉血栓，以避免再脱落的出现，可安放静脉滤器，因此，肺栓塞一出现，必须紧急抢救处理，足量溶栓抗凝治疗为基本原则。