细菌性心内膜炎抗生素治疗要注意以下用药原则：
第一，尽早使用，在三到五次的血液中进行持续的血液培养后进行。
第二，适当用药，有效的药物依赖于消毒，而不是抑制细菌，大的用量，长期的疗程，目的是彻底清除残留肿瘤中的细菌，同时使用各种药物，可以达到迅速的消毒效果。
第三，以输液为主要手段，维持血液的稳定水平。
第四，是在病因未知的情况下，急性期选择抗菌药物，如：链球菌、革兰氏阴性菌，亚急性者则选择抗链球菌。