房颤可能会导致房室内的血流量减缓，产生漩涡，从而导致心房内的粘连。在血栓形成后，随着血液的流动进入左心房，在心脏的收缩阶段，左心房会把血栓喷入主动脉。
由于右颈总动脉和右侧的锁骨下动脉都与脑干相连，所以在心脏中形成的血块会随血液流向脑部，使其变得更细小，使血栓随血液流向无法继续前行的动脉造成阻塞，最终导致脑梗。