脑血栓后遗症主要通过药物治疗和康复功能锻治疗来进行。药物治疗主要是使用具有活血化瘀、芳香开窍疗效的中西药防止血栓复发。康复功能治疗则是配合按摩理疗等辅助手段，逐渐改善血循环状况。脑血栓康复治疗是一个长期的过程，必须持续用药和锻炼。