自身免疫性脑炎与普通病毒性脑炎相比症状比较严重，是一种进展较快的病理，医学上推测可能还有一部分自身免疫性脑炎是慢性的，类似白塞氏脑病，其主要临床表现是精神方面的症状，而神经系统的症状和体征相对较轻，如慢性的头痛、头晕、乏力、手麻脚弊、动作协调性不好、不自主运动、植物神经功能紊乱，熬夜时一过性癫痫发作等。