肝囊肿不见了可能是以下原因导致的，具体分析如下：
1、囊肿的体积很小，直径在1厘米以内，内皮细胞会萎缩，不会分泌出液体，导致囊肿缩小甚至消失。纤维疤痕周围有纤维状的粘连。
2.自身的脓肿，在免疫系统和抗感染的作用下，囊肿会缩小，甚至消失，形成完整的组织，周围的肝脏细胞会分裂，填充缺损。
3.可能是彩超、CT等检查设备，存在一定的误差。