一般情况下，肝囊肿和脂肪肝没有关系。具体情况分析如下：
肝囊肿指的是肝脏内囊性病变，由囊肿包膜和内面所含液体组成，囊肿具有分泌液体的功能，小的肝囊肿不会对人体造成危害，需要定期复查动态观察。肝囊肿直径超过5cm，有压迫症状，提示肝脏胀痛或肝功能异常，可通过经皮肝穿刺抽取囊液或外科手术切除囊肿。
脂肪肝主要是由于脂代谢紊乱导致脂肪在肝脏内沉积，从而导致肝细胞脂肪样变性，从而导致肝功能出现异常，一般见于高脂血症、肥胖、长期饮酒者，脂肪肝严重时可发展为肝硬化甚至肝癌。脂肪肝可以通过控制血脂，控制体重，保肝治疗，定期复查肝脏功能和肝脏超声检查。