低分子肝素钙主要作用于预防和治疗静脉血栓，特别是预防和治疗静脉血栓。
低分子肝素钙一般通过皮下注射，可以与人体血液中的抗凝血酶Ⅲ结合，形成复合物，这能增强患者的凝血酶选择性结合的能力，同时还能抑制凝血酶。如果是用来预防血栓形成，可以每天使用一次低分子肝素钙；如果是治疗血栓引起的，则需要每天使用两次。