百会穴位于头部的顶端，属于足厥阴肝经循行的部位，所以肝部的一些疾病，容易出现百会穴疼痛的情况，比如肝热、肝郁气滞、肝阳上亢等。此外，人体的一些全身性疾病，比如高血压、脑血管痉挛、脑供血不足等，也会出现百会穴疼痛的情况。同时由于头部局部的一些病变，比如偏头痛、神经痛等，也会引起百会穴疼痛。所以百会穴疼痛需要结合全身的情况以及局部的一些病变进行诊断，然后选择恰当的药物进行治疗，必要时到医院做一些相关的检查。