通常肛周脓肿不会自愈，肛周脓肿是因为细菌感染导致，所以发病以后肛管、直肠内会有脓液聚集，而脓液如果不及时排除，只会变得越来越多。新生儿由于伤口愈合很快，所以脓液往往流出来以后，里面脓腔又没有愈合，所以容易导致反复发作，长期不愈而形成肛瘘。