小儿免疫性脑炎的症状有头痛、发烧、恶心、食欲不振。潜伏期为4-21天，一般为10-14天。病毒首先在单核巨噬细胞中繁殖，然后释放到血液中。大多数人在感染后没有表现出症状，但是血液中的抗体会上升，这被称为隐性感染。有些人有轻微的呼吸道症状。极少数病毒通过血脑屏障引起中枢神经系统损伤和脑炎症状。