胚胎停育的原因有生殖内分泌方面，因为胚胎早期的发育的时候需要三个重要的激素水平，雌激素、孕激素、绒毛膜促性腺激素，如果母体内源性激素不足就会造成胚胎的停育。二是生殖免疫问题，如果自身有某种抗体就会导致胚胎的发育。三是子宫的问题，如果子宫的内环境不好或者是畸形也不会发育。第四是染色体问题。