怀孕40多天肚子不舒服，是不正常的，可能是先兆流产或是宫外孕的症状，可以去医院检查，明确诊断，对症治疗。多数女性在怀孕40多天时，会出现有晨起恶心、呕吐、腹胀等胃肠道不适，或者也会出现有尿频、乳房胀痛、浑身疲乏无力等的不适现象。