人流后三个月又怀孕了是可以进行人流的，只是这时候是属于高危人流，子宫没有完全恢复，可能在人流的时候容易导致出现子宫穿孔的并发症。若停经在49天以内，孕囊小于两公分以下，可以用药物来终止妊娠减少伤害，或者再次人流来直接终止妊娠。