甲状腺囊腺瘤的病因尚不清楚，可能与遗传有关。
遗传因素是目前公认的一种病因，家族中经常会出现先后发病的病例，而且大多是女性，这种情况可能与遗传因素有关。还有就是精神创伤，由于各种原因导致的精神过度兴奋或者过度抑郁，导致甲状腺激素分泌过多，其机制可能是在应激状态下肾上腺皮质激素分泌急剧升高，从而改变T淋巴细胞或辅助性T淋巴细胞的功能，从而增强免疫反应。另外，免疫系统的异常也是导致甲状腺囊腺瘤的原因。甲状腺囊腺瘤临床表现复杂多样，主要表现为神经系统，患者会出现紧张、失眠、精神不集中、焦虑、烦躁、甚至出现幻觉等症状，此外还有高代谢综合症，怕热多汗，皮肤、手掌、面部、颈部红润，常伴有低热，危象时会出现心动过速、心悸等症状。