甲亢突眼若为良性只要保守治疗就可以了，挂内分泌科如果甲亢的突眼为恶性，需手术治疗时，应挂眼科。
如果甲亢突眼不是很严重时，就不需要做什么特殊处理了。甲亢突眼在多数情况下呈良性和自限性，即几年后就能自动减轻，并且突眼消失。如果是甲亢恶性突眼时，就是很严重的，会引起永久性眼压增高，导致眼睛失明或者视网膜脱落等并发症。则象此类甲亢突眼等，仅需内分泌科医生指导1次治疗即可，再定期随访。