绝大部分亚急性甲状腺炎病人都能治愈或亚急性甲状腺炎绝大部分病人都能自愈，这是因为该病具有自限性。
当然，少数病人可能会留下永久性甲减，但即使甲减发生，仅需补充生理需量甲状腺激素对症支持治疗。只要病人甲状腺功能保持在正常值范围内，病人症状和体征基本没有，就能像正常人那样工作和学习。亚急性甲状腺炎在治疗上也仅仅是根据相应病症进行对症治疗。