亚急性甲状腺炎多数1-2月份即可痊愈。
亚急性甲状腺炎为自限性甲状腺炎，涉及病毒感染。患者发病后一般没有明显症状，但容易反复发作，且病情较重，需要长期服用抗微生物药物治疗，否则可能发展为慢性甲亢或甲减。发病前约2周出现上呼吸道感染，若咽部不适，流清涕，此后甲状腺区疼痛，可向耳部放射，吞咽时疼痛增加，同时可伴有全身不适，食欲减退，肌肉疼痛，发烧，出汗。
多数病人的预后相对较好，轻型患者服用非甾体类抗炎药，中、重型病人可需激素治疗，很少有病人出现永久性甲状腺功能减退。