中枢性甲减是由于垂体TSH或者下丘脑TRH合成和分泌不足而导致的甲状腺激素合成减少。
先天性原因有垂体、下丘脑发育不全等小儿的病因多为颅咽管瘤。成人的病因大多是垂体的大腺瘤。垂体接受手术和放射治疗，头部损伤、希恩综合征、淋巴细胞性垂体炎等。本病常有性腺、肾上腺受累，如女性产后无乳及闭经、男性性功能减退、皮肤色素变浅、腋毛阴毛脱落等。
中枢性甲减实验室检查为T3、T4降低，TSH降低或正常。