甲状腺炎临床上可分为如下几类：一是亚急性甲状腺炎，其治疗主要根据亚甲炎所致临床症状进行对症治疗。
通常未给予甲状腺激素或抗甲状腺药物治疗，通常不予使用，但亚甲炎留下永久性甲减可使用激素代替治疗者除外。还有桥本氏甲状腺炎就是针对甲状腺肿大病情和甲功而拟定的治疗方案，病情较轻者可暂不治疗。
产后和无痛性甲腺炎的治疗同样以症状为主，通常不使用抗甲状腺药物，由于这两类疾病基本都属自身自限性疾病的范畴，可随时间推移而改善。