亚急性甲状腺炎为病毒感染相关疾病，其病程具有自限性，预后良好。
亚急性甲状腺炎以止痛对症为主，首先，病人可出现颈前区明显疼痛，此时，患者为他服用了非甾体消炎止痛药来缓解疼痛，如收效甚微，也可在短期内用激素缓解疼痛。如果亚急性甲状腺功能亢进症或者亚临床甲亢都可以在服用降糖药之后再进行手术治疗。若亚急性甲状腺炎正处于甲状腺毒症期，病人出现心悸等显著高代谢症状，β受体阻断药可在短时间内应用。如果亚急性甲状腺机能亢进症处于亚临床期则应该在急性期和缓解期交替进行用药。如亚急性甲状腺炎正处于甲减期，此时可短期用小剂量优甲乐代替治疗。对于已经出现甲亢或者亚临床甲亢的病人来说，应该及时服用抗甲状腺抗体抑制剂以及硫唑嘌呤类药物。但是，这类药物均无需长期服用，亚甲炎的预后良好，病人不必过分忧虑。如果是亚临床型的甲亢，则建议使用硫唑嘌呤联合二甲双胍或者硫唑核苷进行治疗。上述计划仅供参考，具体的用药请根据自己的病情，在专业医生的指导下进行。