甲减通常不导致甲状腺炎的发生，相反，自身免疫性甲状腺炎在晚期则可导致甲减。
如果发现自己有甲亢症状，就应该考虑甲减可能。对自身免疫性甲状腺炎伴甲减，治疗以外源性补充甲状腺激素代替治疗为主，使甲状腺的功能保持在正常值，目前还没有哪种方法可以使自身免疫性甲状腺炎患者体内的甲状腺自身抗体转阴，故仅能治甲减一病。如果自己的甲亢症状不严重，就不用太担心了，因为有很多人是因为甲状腺本身分泌过多的甲状腺球蛋白而导致甲减出现。
因此外源性补充甲状腺激素代替治疗，使甲功保持在正常值以内。如果出现严重的并发症则需要进行手术干预治疗。自身免疫性甲状腺炎所致甲减属于终身性甲减，就是要终身服药来代替治疗，多数甲减患者经治疗甲功恢复正常后均能像正常人那样工作、生活和学习。