甲状腺结节是良性的，恶性的可能性不大。
遗传、放射性辐射、甲状腺组织过度增生等都会导致甲状腺结节变恶性。恶性甲状腺结节有一定的遗传性，是由基因缺失引起的甲状腺过氧化物酶活性异常，导致甲状腺激素不能从甲状腺球蛋白中分离释放出来，从而导致甲状腺组织异常，形成恶性甲状腺结节。放射线，长期暴露于辐射环境中，或者曾经在头、颈、胸等部位接受过放射治疗，可能会影响甲状腺，从而形成恶性甲状腺结节。甲状腺组织过度增生是由于缺碘引起的，缺碘会导致甲状腺激素分泌异常，甲状腺组织过度增生，从而导致甲状腺肿，同时还可能伴有甲状腺结节。如果不及时治疗，甲状腺结节会逐渐恶变，形成恶性甲状腺结节。饮食中碘元素对甲状腺的影响最大，摄碘不足或过量都会导致甲状腺病变。随着饮食的丰富，甲状腺结节因碘缺乏而变得极为罕见。一般成年人每天摄取碘100~200微克。