甲状腺功能正常的桥本甲状腺炎患者适当限碘，日常饮食可食用加碘食盐，但需适当限制海带、紫菜、海苔等富碘食物的摄入。
由于个体的差异较大，如疾病发展程度、药物敏感性、依从性、身体素质等。需要医生根据患者的具体情况选择药物。临床甲减（TSH升高且甲状腺激素水平降低）患者，给予左甲状腺素替代治疗，以维持甲状腺功能正常。如果甲状腺肿大特别明显，压迫气管、食道造成呼吸困难、吞咽困难等症状，或者伴有甲状腺恶性病变时，需要进行手术治疗。