久治不愈会导致甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进等并发症。
亚急性甲状腺炎患者会出现发热、甲状腺肿大、颈部疼痛等症状。该病症会导致甲状腺肿大，肿大严重的话，会出现呼吸困难、吞咽困难等症状。亚急性甲状腺炎是引起甲状腺功能改变的主要原因，如发热、心动过速、心慌、多食、身体消瘦、多汗等。甲亢是非常严重的疾病，如果不及时治疗，会引起神经、循环系统、消化系统等系统的兴奋性增高。
其次，可能会破坏甲状腺组织，引起甲减等后遗症。甲减是由亚急性甲状腺炎引起的，主要表现为感觉迟钝、疲劳、嗜睡、记忆力减退。甲减还会导致月经紊乱、闭经、月经过多等。亚急性甲状腺炎会影响患者的生活、身体和心理，一旦确诊需要积极治疗，可以选择抗炎药物、糖皮质激素等药物进行控制。