一般来说，亚临床甲状腺功能减退症主要看甲状腺功能的指标。
促甲状腺激素升高，游离T4的指标正常；促甲状腺激素升高，游离T4的指标下降，都表示亚临床甲状腺功能减退。除此之外，甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体升高，表示可能出现甲状腺炎，而甲状腺有弥漫性肿大的话，就提示桥本甲状腺炎，此种情况下，就可能发展成为亚临床甲状腺功能减退症。